Plateau technique
L’équipe GAD est localisée au sein du bâtiment B3 de l’UFR des Sciences de Santé de l’Université de Bourgogne. Elle a accès aux équipements du Centre de Recherche Inserm UMR1231 ainsi qu’aux différentes plateformes Grand campus de l’Université de Bourgogne.
Son plateau technique regroupe des équipements de :
- Biologie moléculaire : séquenceur moyen débit (MiSeq – Illumina), PCR, PCR quantitative, clonage, CGH-array, cartographie optique (Saphyr – Bionano genomics)
- Biologie cellulaire (culture cellulaire, western blot, immunohistochimie immunofluorescence, ELISA, cytométrie en flux, microscope à fluorescence ..).
- Comportement du petit animal
- Histologie : microtome HM450, cryostat et vibratome VT1200S
- Imagerie 3D: microscopie épiscopique à haute résolution
- Electrophysiologie : multi-électrode array
L’équipe GAD a par ailleurs mis en place une plateforme de bioinformatique en collaboration avec le centre de calcul de l’Université de Bourgogne, basée sur des outils tels que LabKey et Galaxy. Cette plateforme analytique permet à tous les usagers de l’équipe de traiter, interpréter et visualiser les données sur un serveur centralisé. Cette plateforme est à l’origine de la création de la plateforme bioinformatique de l’institut GIMI, nommée BIOME et labellisée plateforme Grand Campus par l’Université de Bourgogne en 2018.
La majorité des équipements de l’équipe GAD a été financée par le Conseil Régional de Bourgogne, le CPER et le FEDER.
L’équipe poursuit également sa forte collaboration avec les centres d’investigation clinique et d’épidémiologie clinique, et plurithématique.
Organisation et synergie du plateau
- UF6254 Innovation en diagnostic génomique des maladies rares – Pr Christophe PHILIPPE
- BIOME, Plateforme de bioinformatique de l’Institut GIMI – M. Yannis DUFFOURD
- Plateforme CGH-array du CHU Dijon Bourgogne – Pr Patrick CALLIER
- CR Inserm UMR 1231 et animalerie – Pr. François GHIRINGHELLI
- CR Inserm CIC-1432 – Pr Christine BINQUET, Pr Marc BARDOU
